Jeg heter Tine og i denne praksisen har jeg vært så heldig å få være med på et forskningsprosjekt som foregår ved klinisk institutt 2 på Haukeland sykehus. Klinisk institutt 2 er på laboratoriebygget og er en klinisk og translasjonell forskningsenhet som utfører både klinisk og laboratoriebasert forskning. Instituttet tilhører det medisinske fakultet og dekker mange aktiviteter, som medisinsk biokjemi, revmatologi, kardiologi, immunologi, osv.
Forskningsprosjektet jeg har fått delta i heter “FTIR spectroscopy and computational profiling of small extracellular vesicles (sEV) in obesity and cardiovascular dysfunction.” Kort fortalt handler prosjektet om sammenhengen mellom fedme og hjerte- og karsykdom, og hvordan små ekstracellulære vesikler (sEV) i blodet kan brukes som markører for tidlige endringer i hjertet. Slike vesikler fungerer som små «budbringere» som transporterer bioaktive molekyler mellom celler, og de kan derfor gi verdifull informasjon om hva som skjer i kroppen. Målet er at dette arbeidet på sikt kan bidra til utviklingen av nye, ikke-invasive metoder for tidlig oppdagelse av hjertesykdom.
For å kunne studere sEV isolert, brukes forskjellige metoder for seperasjon og ekstraksjon av prøvemateriale. sEV analyseres både fra plasma og serum, som må skilles fra resten av blod ved runder med sentrifugering. Deretter utføres SEC (size exclusion chromatography) som renser prøvematerialet videre basert på størrelse til de ekstra cellulære vesiklene. Videre analyseres prøvene med DLS apparat (Dynamic Light Scattering). Dette er en fysikkbasert metode der man måler hvordan laserlys spres når det treffer vesiklene. Ut fra lysets spredning kan vi beregne størrelsesfordelingen (PDI) til partiklene i løsningen. DLS gir oss altså en oversikt over hvor store vesiklene er, og hvor jevn prøven er. TEM (Transmission Electron Microscopy) kan også brukes til analysere nanostruktur på atomnivå og kan indikere om sEV er isolert tilstrekkelig.
Neste del av analysen er en metode som heter FTIR-spektroskopi (Fourier-Transform Infrared Spectroscopy). Denne teknikken kan analysere den molekylære sammensetningen i vesiklene og dermed avdekke mønstre knyttet til proteiner, lipider og nukleinsyrer. Ved å kombinere dette med bioinformatiske analyser håper man å kunne finne tydelige signaturer som viser risiko for hjerte- og karsykdom hos personer med fedme – også før sykdommen er synlig gjennom vanlige diagnostiske metoder.
Jeg har fått delta på hele prosessen fra blodprøvemateriale kommer fra klinikk på sykehuset til FTIR analysen som gjøres på kjemisk institutt på UiB. Fremover skal jeg jobbe selvstendig med apparatene og lære hvordan jeg kan analysere spektroskopi fra FTIR ved hjelp av databehandling og mønstergjenkjenning av flervariabel data.
Så langt har dette prosjektet vært veldig spennende og gir mulighet til å kombinere laboratoriearbeid med avanserte analysemetoder. Jeg har sett viktigheten av at alle deler av prosessen både isoleres med riktige teknikker og analyseres korrekt for å sikre reproduserbarhet og redusere mulige feilkilder.
Alt i alt har praksisen vært både lærerik og inspirerende, og jeg gleder meg til å følge prosjektet videre og lære mer underveis!

Hilsen Tine