Hei bloggen! Vegard her igjen. Meg og Hevar sin praksisperiode hos Patologi i Vest (PiV) går nå mot slutten. Vi har siden forrige gang fortsatt på arbeidet som vårt. Arbeidet er å utarbeide en kvalitetskontroll (QC) for Hematoxylin-Eosin-fargede ikke-neoplastiske nyrebiopsier, og evaluere om de holder en viss standard. Ved å benytte oss av metoder innen programmering slik som dimensjonalitetsreduksjoner, embeddinger og maskinlæring har vi fått noen ganske gode visualiseringer og resultater. Disse har vi oppnådd ved å først og fremst se på forskjellige fargeverdier, og se på hvordan de er i forhold til hverandre. Gjerne med utgangspunkt i hvilken scanner som er blitt brukt, eller hvordan forskjellige sykehus sammenligner med hverandre. 

 

Frem mot endt praksis i midten av mai, skal vi prøve å få på plass en kode hvor man kan sende inn et vevssnitt av nyre og deretter få ut grafer og gi snittet en form for ‘’scoring’’ for å evaluere dets kvalitet. Se vedlagt bilde av kladd. Gjennom denne oppgaven har vi satt oss inn i enormt med bibliotek og fått erfaring med å jobbe med digre datasett. Det er først nå at vi virkelig har skjønt viktigheten av fagene INF100 og INF161. Egenskapene man tilegner seg her kommer trolig godt med uansett hva man ender opp med å jobbe som. 

 

Noe av det mest spennende og lærerike har vært å se hvordan et slikt forskningsfellesskap fungerer.  Alle har sine prosjekter, og alle er oppdatert på hva hverandre jobber med gjennom ukentlige møter foran en tavle. Hos PiV er det mange forskjellige akademiske bakgrunner, noe som skaper et veldig tverrfaglig team. Selv om litt mer kunnskap om både programmering, patologi og KI hadde forbedret forståelsen av de andres prosjekt noe, så er det veldig givende å følge med på de andres sysler. Det at det finnes såpass mange prosjekter innenfor dette litt snevre forskningsområdet som er dataassistert patologi er utrolig kult. Selv om vi bare er praksisstudenter, så har vi blitt inkludert i de aller fleste møter som likemenn. Denne inklusjonen har gjort det til et helt herlig sted å ha praksisen sin. 

 

Vi er klare og motivert til å fullføre prosjektet, og er så langt veldig takknemlig for erfaringene vi har fått her.