Hei! Vi er Stine og Andrea og vi er så heldige å få være i praksis hos PiV, Patologi i Vest, dette semesteret. PiV består av to avdelinger, en i Stavanger som jobber mest med kreft diagnostikk og en her i Bergen på Haukeland som jobber mest med kronisk nyresykdom. Kronisk nyresykdom er forventet å bli den femte mest dødelige sykdommen innen 2040. Dette vil da passere alle typer kreft. Kronisk nyresykdom kommer til å kreve masse arbeidskraft og tid for å diagnostisere og behandle korrekt. Målet er at KI skal kunne assistere patologene slik at det diagnostiske arbeidet blir mer effektiv. Det er dette vi jobber med i PiV. 

Vår arbeidsplass er i et åpent kontorlandskap på Eitri, knyttet til Haukland, UiB og VIS. Her er vi omringet av kunnskapsrike kollegaer som for eksempel patolog og dataingeniører. Vårt prosjekt er i krysningspunktet mellom patologi og programmering, så vi er i gode hender.

Vi er så heldige å få jobbe videre med et pågående prosjekt som tidligere praksisstudenter fra MTEK har utviklet. Dette prosjektet handlet om å klippe ut deler av nyrebiopsi slik at bare tubuli viser, som du kan se på bildene under. For å så prøve ulike strategier for clustering. Vår oppgave fremover er å forbedre og optimalisere den allerede utviklede koden og se på hvordan ulike endringer vil påvirke clusteringen av nyretubuli og forhåpentligvis føre til et mer nyttig verktøy for fremtidig klassifisering. Første steg for oss vil være å utvikle visualiseringen på clusteringen slik at patologen på avdelingen kan se på om clusteringen gir mening. Før vi så skal begynne å endre på features og teste ut andre clusteringmetoder.

Figur 1: Utsnitt av nyrebiopsi med ulike typer skadet nyretubuli

Hver praksisdag starter med et individuelt møte med veileder, der vi diskuterer oppståtte utfordringer og hvordan gå frem for å nå målet. Videre blir vi med i ukesmøtet til PiV, hvor vi får et innblikk i andre sine prosjekt, nye forskningsartikler og/eller et kort foredrag fra forskjellige fagfelt. Her er det masse nytt å lære. Vi er veldig takknemlige for all kunnskap og ikke minst hvordan en forskningsprosess er, fra ide til utvikling og til slutt publikasjon. På PiV får vi virkelig et innblikk i hvorfor MTEK er en nyttig utdanning.

Vi gleder oss masse til å lære mer! Vi snakkes i neste blogginnlegg.

Med vennlig hilsen

Stine og Andrea