Hei bloggen! Hevar og meg (Vegard), har vært så heldige å få ha vår praksisperiode her hos Patologi i Vest (PiV) på Eitri, en del av Haukeland Universitetssykehus. PiV er et senter for anvendt digitalisering i patologitjenesten, og er et strategisk forskningsprogram med samarbeid mellom Helse Bergen og Helse Stavanger. Essensen i det arbeidet som foregår her er komputasjonell patologi, kunstig intelligens, etableringer av kvalitetskontroller og rammeverk eller andre meningsfulle forbedringer innen patologitjenesten. Her har vi nå vært i omtrent en måned, og trives godt med arbeidet og arbeidsmoralen som finnes her. Et team av voldsomt flinke og morsomme folk med ulike bakgrunner som medisin, ingeniørvitenskap og IT gjør at det her finnes en enorm tverrkompetanse. Med hver vår kontorplass, og mange møter hvor vi får pulsen til arbeidsstedet har gjort at vi allerede føler oss som en del av dette teamet.
De tidligere MedTek-studentene som har vært her har hatt forskjellige prosjekt å jobbe med, og det har vi også fått. Vår jobb her er å bygge videre på det prosjektet Borghild hadde for noen år tilbake. Hennes jobb var å ekstrahere informasjon ut ifra histologisnitt fra nyrebiopsier og etablere en kvalitetskontroll for om nyresnittet opprettholder en viss standard. Disse snittene er farget med noe som heter Hematoxylin-Eosin for å bedre klargjøre strukturene i vevet. Hematoxylin farger cellekjernene blå, og eosin farger andre celleorganeller og ekstracellulært vev rosa. Ved å se på fargedistribusjon, grad av vev på bildene og andre egenskaper ved slike biopsisnitt, har hun lagt rammeverket for vårt arbeid.
Vi har nå fått et mye større datasett med nyresnitt fra mange forskjellige sykehus over mange år. Ved å analysere disse nyresnittene for å hente ut så mye informasjon som mulig, så håper vi at vi kan lage et verktøy som henter inn nok informasjon til at vi klarer å etablere om et nytt bilde opprettholder ønsket standard. Dette er viktig av flere årsaker, men hovedårsaken er at dårlig farging kan føre til uklare resultater. Dette er veldig dumt dersom noen krever rask behandling, men bildet er for dårlig til å finne ut av det. Ukentlige møter dedikert til vårt prosjekt hvor vi får veiledning, tips og hjelp til det vi eventuelt måtte lure på. Det er mye å sette seg inn i, men fagene BMEDFYS, INF100 og spesielt INF161 letter prosessen noe. Litt mer histologikunnskap hadde heller ikke skadet, selv om dette ikke er en nødvendighet for det arbeidet vi gjør.
Hevar sitt blogginnlegg vil gå litt mer inn på hvordan vi jobber med prosjektet vårt og hva vi har gjort så langt! Vi gleder oss veldig til å fortsette dette prosjektet og kan nesten ikke vente med å dele hva vi har oppnådd med dere når den tid kommer.
Til neste gang, bloggen! <3 Hilsen Vegard Grydeland og Hevar Mokhlis
Her er et bilde av et typisk histologisnitt fra en nyrebiopsi og en av de mange maskinene som brukes innen tillagingen av slike bilder.
